Los principales proyectos son la cría y conservación del Tucán Toco, del Moitú, del Guacamayo Rojo y el Cardenal Amarillo.
Además de los proyectos de conservación directa, en el Parque de la Biodiversidad se llevan a cabo proyectos de investigación sobre el comportamiento y la biología de especies menos conocidas: el oso melero, la tortuga terrestre y la canaleta.
